פרופ' יונתן בן-דב עוסק בחקר מגילות מדבר יהודה והספרות האפוקליפטית, בהקשרם בעולם העתיק.
הוא היה צעיר המשתתפים בפרוייקט של פרסום המגילות בסידרה DJD, כאשר סייע לפרופ' שמריהו טלמון ז"ל בפרסום מגילות לוח השנה.
הוא עמל כעת על פרסום של המגילות שנכתבו בצופן (cryptic A) ועל מהדורה ופירוש מחודשים לחיבור החוכמה "מוסר למבין" (חוכמת רז נהיה, 4QInstruction).
המהדורות נערכות בשיתוף קבוצה של תלמידי מחקר וחוקרים צעירים. פרופ' בן-דב הוא מנהל-שותף של פרויקט הדיגיטציה הבינלאומי Scripta Qumranica Electronica,
ועורך-שותף של הסידרה Studies in the Texts from the Desert of Judah (Brill publishers).

לצפייה ברשימת הפירסומים של פרופ' יונתן בן-דב